Prometheus passa-se na Terra, no ano de 2058, em que é encontrado na África Pinturas Rupestres, aparentemente produzidas por extraterrestres. Financiados pela corporação de Peter Weyland os cientistas Elizabeth Shaw e Charlie Holloway partem em buscam de respostas sobre a origem da humanidade.
Ao chegarem em um estranho planeta aparentemente inabitado , os tripulantes da Prometheus encontram seres alieníginas de uma civilização antiga que possuem comportamentos não tão civilizados.